La Stazione ha il fulcro nel complesso Punte Alberete e Valle Mandriole.
Punte Alberete è un bosco igrofilo primario, inframmezzato da radure con prati umidi e cariceti, bassure allagate con canneti e lamineti, macchie arbustive palustri.
Valle Mandriole, invece, presenta estesi canneti di elofite miste, acque aperte con vegetazione idrofitica, lamineti, il tutto cinto da macchie arbustive palustri.
La Stazione ha altri ambienti di grande pregio, come la Pineta di San Vitale, il più settentrionale e più vasto dei residui delle pinete che storicamente cingevano a mare la città di Ravenna. La pineta è attraversata da nord a sud dalla Bassa del Pirottolo, zona umida di acqua da dolce a salmastra, con canneti e giuncheti.
La Pialassa della Baiona è una estesa zona umida lagunare, in contatto con il mare Adriatico tramite una rete di canali che la suddividono in chiari, separati da argini erbosi con filari di tamerici.
Le dune grigie di Casalborsetti e gli antistanti relitti dunosi attivi da Casalborsetti a Porto Corsini, rappresentano rari esempi di ambienti tipicamente costieri, quali le dune consolidate coperte di macchia termofila, i prati aridi di colonizzazione delle sabbie consolidate, le dune costiere attive.
Il Bardello è una preziosa prateria umida e allagata, l'ultima di acqua dolce dell'intero Delta del Po, evolutasi su suoli in alcuni punti sabbiosi, in altri argillosi, con numerose bassure periodicamente allagate con acque oligotrofiche, che ospitano interessantissime praterie umide con rare specie di piante, anfibi, rettili e insetti.
